在大多数常规的实验项目中，物性测量系统已经设计好了全自动的测量软件和具有标准测量功能的硬件，如电阻率、磁阻、微分电阻、霍尔系数等。经过独特而巧妙的设计，评价高的物性测量系统上各种测量选件之间能够互不干扰，且能够简单快速的相互切换。除此之外，在应用物性测量系统时需要注意以下问题。
1.避免测量错误磁场值，需保持磁场量
由于在物性测量系统中磁场值不是由霍尔片等磁场传感器测量的，而是由超导磁体的电流乘以磁体常数计算得到的，在超导磁体电流为零时，由于冻结磁通可能造成测量错误。用物性测量系统可以测量样品的直流磁化强度和交流磁化率，因此每次测量必须注意保持剩余磁场的量，特殊情况必须使用超低场装置。
2.控制温度，保持流阻畅通
物性测量系统关键是必须保持流阻的畅通，用系统可以测量样品在确定磁场下交直流电阻随温度的变化，使流阻畅通后重新加入液氦，运行系统。其中氧分子团和氮分子团是造成流阻堵塞的主要原因。
3.测量I-V曲线，确定样品变化
物性测量系统在测量确定温度和确定磁场下样品的I-V曲线和临界电流时，需注意测量在确定磁场下样品比热随温度的变化，及确定样品的相变温度，以此可方便地得知在确定磁场下样品热导率和Seebeck系数随温度的变化，利于研究非平衡态性质。
物性测量系统的设计理念是在一个控制的低温和强磁场平台上，集成全自动的磁学、电学、热学和形貌。因此在使用过程中需注意系统各部分连接，充分利用物性测量系统的技术优势。也由于这样的设计使得整个系统得到充分的利用，将极大减少了客户购买仪器的成本。